При строительстве населенного пункта, преобразованного впоследствии в г.Северск, был образован лагерный суд ИТЛ и строительства № 601 МВД СССР, который приказом министра юстиции СССР от 27 сентября 1949 года был переименован в лагерный суд ИТЛ и строительства "ГХ" МВД СССР.

Первым председателем Указом Президиума Верховного Совета СССР от 27 декабря 1949г. был избран Тихонов Георгий Степанович. Состоял в должности председателя по май 1958 года. Переведенный в один из закрытых городов Урала, Тихонов Г.С. еще много лет трудился в судебной системе.

Вместе с Тихоновым у самых истоков образования Северского городского суда стояли Владимирский Константин Дмитриевич - заместитель председателя суда, и Шиморин Александр Васильевич - член суда. Кроме них, в состав суда входили еще 7 человек: заведующая секретариатом В.П. Шилова, (после замужества - Гончарук), 2 секретаря судебных заседаний М.Г. Дубина и Н.А. Сальникова, машинистка О.Г. Пантелеева, на которую также были возложены обязанности бухгалтера, судебный исполнитель В.Е. Вех, нотариус Л.А. Елисеева, курьер-уборщица.

Располагался суд первоначально в небольшом деревянном двухэтажном доме по ул. Берия, д.3 (ныне ул. Первомайская). До настоящего времени этот дом не сохранился. К 1954 году штат суда увеличился еще на 5 единиц. Были введены должности бухгалтера (Е.П. Гармаш, А.Я. Козловская), еще одного члена суда (В.Т. Ермаков) и секретаря судебных заседаний (М.Б. Некрасова), а также двух адвокатов (Е.П. Петровская и А.В. Иванова).В это время суд уже находился в двухэтажном кирпичном доме по ул. Мира, д. 15. Кроме суда, в этом же здании располагались прокуратура, нотариус и адвокаты.

Уже в первые годы становления суда судьи зарекомендовали себя грамотными, высокопрофессиональными юристами, умелыми организаторами, поэтому по распоряжению Управления Министерства юстиции РСФСР они часто выезжали в командировки в Юргу, Кемерово, Новосибирск, Барнаул, Бийск для рассмотрения конкретных, наиболее сложных уголовных дел.

В 1956 году в соответствии с приказом председателя Верховного суда СССР суд стал именоваться специальным судом "60". В 1979 году спецсуд "60" преобразован во Вторую постоянную сессию Томского областного суда. В 1992 году Вторая постоянная сессия Томского областного суда реорганизована в городской народный суд города Томск-7. В 1994 году случилось еще одно преобразование. Томск-7 был переименован в город Северск, соответственно и суд получил новое название - Северский городской суд Томской области.С июня 1958 года председателем спецсуда "60" избирается К.Д. Владимирский, а его заместителем - Чирков Николай Дмитриевич, в течение двух предыдущих лет работавший членом спецсуда "60". В 1959 г. членами суда назначены Шатунов Владимир Прохорович (работал в суде чуть менее трех лет) и Ситняк Владимир Савельевич. Секретарями судебных заседаний в это время работают Е.Н. Голикова, Н.А. Буркова, М.Б. Некрасова, Н.А. Самойлова.

В 1959 году суд вместе с прокуратурой, адвокатами и нотариусами переехал в более просторное 3-х этажное здание по ул. Калинина, д. 29 (суд занимал 3-й этаж).В 1962 году членом суда назначается Ю.П. Гуторов, в 1963 году - А.И. Безбородов и И.Н. Белоногова. К.Д. Владимирский возглавлял суд в течение четырех лет, до мая 1962 года затем был переведен в город Арзамас Горьковской области, после чего переехал в г. Ростов-на-Дону. В конце 60-х он погиб в автокатастрофе.
Чирков Николай Дмитриевич состоял в должности заместителя председателя в течение 12 лет. В 1955 году окончил юридический факультет Казанского государственного университета. Комиссией по распределению молодых специалистов направлен в качестве стажера народного судьи в распоряжение Министерства юстиции Мордовской АССР, при котором состоял с сентября 1955 года до января 1956 года. С февраля 1956 года - член суда "60", с мая 1958 года по февраль 1970 - заместитель председателя суда "60". Уволился переводом в УРС СХК начальником отдела кадров, где проработал до 24 марта 1992 года.В.П. Шатунов состоял в должности члена суда чуть менее 3-х лет. Серьезная болезнь сердца оборвала его жизнь. Приказом №10 от 27.04.1962г. он исключен из штата суда с 06.04.1962г. в связи со смертью.

В 1962 году членом суда назначается Ю.П. Гуторов, в 1963 году - А.И. Безбородов и И.Н. Белоногова.

На смену К.Д. Владимирскому председателем суда "60" с мая 1962 года избирается Елагин Николай Епифанович. В 1947 году окончил Новосибирскую межобластную юридическую школу и был направлен в Томскую область в распоряжение Управления Министерства юстиции по Томской области.

До избрания председателем суда "60" Н.Е. Елагин в течение 2-х лет (1949-1951г.г.) работал судьей Каргасокского района Томской области, затем в течение 2-х лет (1951-1953г.г.) - народным судьей 2-го участка Куйбышевского района г. Томска. С марта 1953 г. по октябрь 1956 г. - председатель Томского областного суда, затем до мая 1962 г. заместитель председателя Томского областной суда.

Суд "60" Н.Е. Елагин возглавлял на протяжении 14 лет (май 1962г. - апрель 1976г.). До февраля 1970 года его заместителем был Н.Д. Чирков, затем с февраля 1970 г. по март 1973 г. им стал Михаил Иванович Швед, работавший до этого в течение трех лет членом этого же суда.

В марте 1973 года М.И. Швед переехал в город Томск и продолжил работу в должности заместителя председателя Томского областного суда. Сменил М.И. Шведа на должности заместителя председателя суда "60" Виктор Иванович Мальгин (член этого же суда с 1969г. по 1973г.).

Мальгин Виктор Иванович в 1953 году окончил юридический факультет Томского государственного университета. С октября 1952 г. по февраль 1969 г. работал в Томске и Томской области членом коллегии адвокатов, заведующим Томской сельской юридической консультацией, народным судьей Кировского района г. Томска, членом областной коллегии адвокатов, членом Томского областного суда, старшим литсотрудником областной газеты "Красное знамя".
В должности заместителя председателя суда состоял 11 лет, а всего посвятил Северскому суду 25 лет. В.И. Мальгин - участник Великой отечественной войны. Награжден медалью "За Победу над Германией в Великой Отечественной войне 1941-1945 г.г." и юбилейными медалями "Двадцать лет Победы в Великой Отечественной войне" и "Тридцать лет Победы в Великой Отечественной войне". Член Союза журналистов СССР.

В апреле 1976 года председателем суда "60" избран М.И. Швед. Состоял в должности председателя по ноябрь 1985 года.

После освобождения от должности члена суда в связи с уходом на пенсию А.И. Безбородова в ноябре 1972 года членом суда избирается Алла Дмитриевна Михайлова, уже имевшая к этому времени богатый опыт работы адвокатом в Томской областной коллегии адвокатов.
Двух замечательных людей, высококвалифицированных, грамотных юристов - В.И. Мальгина и А.Д. Михайлову на долгие годы судьба свела в Северском городском суде. Свой путь судья В.И. Мальгин начинал в 1953 году в народном суде Туганского района Томской области. В мае 1960 г. на работу в Туганскую юридическую консультацию была переведена и А.Д. Михайлова. Здесь они работали вместе недолго - полгода. Затем, в течение последующих 7-8 лет А.Д. Михайлова работала адвокатом в юрконсультациях Томского и Ленинского районов, а В.И. Мальгин народным судьей Кировского района г. Томска, адвокатом, членом Томского областного суда, старшим литературным сотрудником областной газеты "Красное знамя".

В феврале 1969 года В.И. Мальгин избран членом суда "60" и переезжает в г. Томск, где А.Д. Михайлова в это время работает заведующей юрконсультацией. В городском суде В.И. Мальгин с 1973 г. по 1984 г. работал в должности заместителя председателя, затем ушел в отставку. С 1988 г. по 1998 г. работал в суде старшим консультантом.
А.Д. Михайлова почти тридцать лет посвятила работе в суде "60". За долголетний, добросовестный труд она награждена медалью "За трудовое отличие", нагрудным знаком "За успехи в работе", имеет почетное звание "Заслуженный юрист РФ".

После отставки В. И. Мальгина на должность заместителя председателя суда в августе 1984 года избирается Пентегов Герман Иванович, работавший до этого в течение 4-х лет (1968-1974 г.г.) членом Томского областного суда, затем в течение 10 лет (1974-1984 г.г.) - заместителем начальника Отдела юстиции Томского облисполкома. В ноябре 1985 г. он назначается на должность председателя суда, а его заместителем с этого же времени назначается Кужирная Ольга Георгиевна. А спустя три года (в 1988 году) она становится председателем Северского городского суда.

О.Г. Кужирная в 1972 году окончила юридический факультет Томского государственного университета. В суд пришла работать в 1973 году, до этого продолжительное время была нотариусом 60-й государственной нотариальной конторы. В эти годы ее учителем, верным помощником и другом стала Вера Павловна Горбунова, старший государственный нотариус. С июня 1983 года О.Г. Кужирная назначена членом Второй постоянной сессии Томского областного суда. Пытливый ум, высокое чувство долга, постоянное стремление к повышению профессионального уровня способствовали ее продвижению по служебной лестнице. Через 2 года работы судьей она стала заместителем председателя, а еще через 3 года - председателем суда.
О.Г. Кужирная - высокопрофессиональный юрист, умелый организатор, требовательный руководитель. В течение многих лет Ольга Георгиевна возглавляла государственную экзаменационную комиссию юридического отделения Северского промышленного колледжа, принимала активное участие в совершенствовании учебного процесса, наилучшей подготовке юридических кадров. Длительное время О.Г. Кужирная являлась членом Совета судей и членом квалификационной коллегии судей Томской области. За заслуги в укреплении законности и правопорядка, большой вклад в дело становления Северского городского суда, достижения высоких личных показателей Ольга Георгиевна неоднократно поощрялась Министром юстиции, Губернатором Томской области, Главой Администрации ЗАТО Северск. В 1991 году награждена нагрудным знаком Министерства юстиции СССР "За успехи в работе, а в 1998 году - медалью ордена "За заслуги перед Отечеством" 2 степени. Она единственная из всех судей Томской области удостоена такой высокой награды. 14 мая 2002 года Высшей квалификационной коллегией судей Российской Федерации О.Г. Кужирной присвоен первый квалификационный класс. Указом Президента РФ от 28 июля 2004 года присвоено почетное звание "Заслуженный юрист Российской Федерации". 17 февраля 2007 года О. Г. Кужирная вышла в почетную отставку.

В течение 12 лет ее заместителем была Марина Евгеньевна Селина, которая в настоящее время работает судьей Московского городского суда. М.Е. Селина в 1978 году окончила юридический факультет Томского государственного университета. С сентября 1973 года по август 1975 года - секретарь судебных заседаний, секретарь суда "60". С августа 1978 года по декабрь 1980 года - консультант Второй постоянной сессии Томского областного суда. С 1988 г. по 2000 г. - заместитель председателя Северского городского суда. С октября 2000 г. - судья коллегии по уголовным делам Томского областного суда.

После ухода М.Е. Селиной заместителем председателя суда в декабре 2001 года была назначена судья Уварова Тамара Владимировна. Т.В. Уварова начала свою трудовую деятельность в судебной системе с должности секретаря судебных заседаний Советского районного народного суда г. Томска в 1978 году. Работала старшим инспектором, помощником председателя суда, адвокатом. С 1993 года по 2001 год состояла в должности судьи Северского городского суда, с января по октябрь 2007 года Тамара Владимировна исполняла обязанности председателя суда, со 2 ноября 2007 года отчислена из штата судей в связи с назначением на должность судьи Томского областного суда.
В феврале 2006 года Т.В. Уварова за долголетний, добросовестный труд, конкретный личный вклад в развитие судебной системы области и совершенствование правосудия, была награждена памятным сувениром "Золотая Фемида".

В 2005 году в Северском городском суде в штат была введена вторая должность заместителя председателя суда, на которую 31 марта 2005 года была назначена Болотина Татьяна Александровна. В Северском городском суде она работала с 10 января 1995 года по 21 августа 2015 года в должности судьи, имеет второй квалификационный класс, являясь одной из самых опытных и высококвалифицированных судей, рассматривала уголовные дела особой сложности.

С 28 мая 2011 года по 23 декабря 2013 года заместителем председателя суда по уголовным делам являлся Коновалов Евгений Николаевич. С 21 октября 2014 по 5 августа 2020 года заместителем председателя суда по уголовным делам являлся Бадалов Ялчин Дурсунович.

На должность заместителя председателя суда по гражданским делам 23 мая 2008 года была назначена Елена Викторовна Шерстабоева. До назначения Е.В. Шерстабоева работала мировым судьей Северского судебного района, а с 12 июня 2007 года судьей Северского городского суда. С 03 июля 2011 года Е.В. Шерстабоева находится в почётной отставке. С 2012 по 2017 год заместителем председателя суда была Кокаревич Ирина Николаевна. С марта 2018 года по май 2021 года заместителем председателя суда по гражданским делам являлась Галанова Людмила Владимировна.

Указом Президента РФ от 14.07.2022 № 450 заместителем председателя Северского городского суда Томской области был назначен Елисеенко Андрей Геннадьевич.

С 18 сентября 2008 года председателем Северского городского суда был Дубовик Николай Павлович. 27 октября 2009 года Дубовик Н.П. был назначен председателем Иркутского областного суда, а в настоящее время является судьей Верховного Суда РФ.

С 27 мая 2010 года суд возглавлял Ребезов Сергей Андреянович, назначенный Указом Президента РФ № 651. С 28 июня 2013 года Ребезов С.А. находится в почётной отставке.

Указом Президента РФ от 23.06.2014 № 446 председателем Северского городского суда Томской области назначен Харжевский Александр Владимирович. С 1 июня 2020 года Харжевский А.В. находится в почетной отставке.

Указом Президента РФ от 09.08.2020 № 504 председателем Северского городского суда Томской области назначен Останин Владимир Алексеевич.

В настоящее время в Северском городском суде работают судьи: Елена Станиславовна Николаенко, Андрей Геннадьевич Елисеенко, Ирина Николаевна Кокаревич, Ялчин Дурсунович Бадалов, Елена Сергеевна Максимова, Елена Николаевна Гуслина, Софья Валерьевна Панкова, Анна Викторовна Ребус, Елена Владимировна Карабатова, Марина Вячеславовна Бершанская, Елена Анатольевна Самойлова.